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MATLAB

Sites Oficiais

Para acessar a documentação oficial para as funções disponíveis no MATLAB acesse:

 

https://www.mathworks.com/

 

E para tirar dúvidas na comunidade acesse:

 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/

Curso de Introdução ao MATLAB

Curso Introd. MATLAB

Acesso ao MATLAB no servidor

Acesso MATLAB servidor

Para os que precisam deixar rodando scripts demorados do MATLAB no servidor.

Faça login na sua conta no servidor (ou sua máquina linux no laboratório):

  • ssh usuario@ipmaquina

 

Mande o matlab rodar seu script:

  • nohup matlab -nosplash -nodisplay -nodesktop < meuscript.m > output.log &

O nohup irá garantir que após sair da sua conta o MATLAB continue rodando.

No output.log será salvo os dados impressos na tela. Para ver o andamento (e ver se o script não teve falhas também) basta dar:

  • less output.log

ou

  • cat output.log

 

-nodisplay, -nosplash e -nodesktop garantem que a execução ocorra sem a abertura de janela gráfica do MATLAB.

O & garante que o terminal fique livre de volta para sair da sua conta usando exit.

Biblioteca do Roberto

Biblioteca Roberto

*acesso privado*

Solicitar acesso para bioinfodiscentes@gmail.com.

SWeep

SWeeP

*acesso privado*

Solicitar acesso para bioinfodiscentes@gmail.com.

manage-fasta-files

manage-fasta-files

Monique Schreiner - 04/06/2019

Funções úteis para lidar com arquivos FASTA no MATLAB como: concatenar fastas, separar um único fasta em vários, retirar sequências de espécies e genes específicos do arquivo fasta, listar espécies, listar gêneros, etc.

Algumas funções requerem MATLAB 2017 ou superior.

Link aqui

BIOINFO-TOOLS

BIOINFO-TOOLS

Camila P Perico - 16/12/2019

Ferramentas e funções de Bioinformática e Inteligência Artificial:

  • gaGo - Algoritmo Genético básico - Autor: Prof. Dr. Roberto T Raittz

Funções compatíveis com MATLAB e, algumas, com OCTAVE

Link aqui

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