Introdução ao Python e Biopython

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A linguagem Python é amplamente utilizada em diversas áreas do conhecimento, inclusive na área biológica. Este curso é um primeiro passo para quem tem interesse em aprender esta linguagem e aplicá-la em seus trabalhos. Também abordaremos alguns métodos básicos para manipulação de arquivos de sequências biológicas e consultas em banco de dados biológicos com o pacote Biopython.

TÓPICOS ABORDADOS:

• tipos de variáveis, listas e dicionários;
• estrutura condicional (if, else, elif);
• estrutura de repetição (loop for e while).
• criação de funções;
• expressões regulares (regex);
• manipulação de dados (pandas);
• criação de gráficos (seaborn);
• Manipulação de sequências genéticas;
• Consultas ao NCBI
• Gráfico de diagrama genômico
• Execução do BLAST
• Consulta ao PDB
• Consulta ao KEGG

PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de informática
• Minicurso de Introdução à Bioinformática

MINISTRANTES:

Charlie F Liberati da Silva

Cientista da Computação pela Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO-PR) e Mestrando em Bioinformática no Laboratório de Inteligência Artificial Aplicada à Bioinformática da UFPR.

Guilherme T Ribas

Mestrando em Bioinformática no Laboratório de Inteligência Artificial Aplicada à Bioinformática. Engenheiro Eletricista formado pela Universidade Tecnológica Federal do Paraná.